В 1928 году была создана команда «Динамо» при НКВД города Краснодара. Этот коллектив быстро набирал силу и вскоре стал одним из сильнейших в регионе.Спустя 20 лет краснодарское «Динамо» стало чемпионом РСФСР!
Несколькими годами позже, в 1954 году, команда перешла в общество «Нефтяник» и под новым названием дебютировала в Классе «Б» чемпионата СССР.
В 1958 году коллектив вошёл в состав ДСО «Труд». Но выступала команда под именем «Кубань».
Ещё через два года команда перешла в ДСО «Спартак». В 1962 году команда становится чемпионом РСФСР. Оставаясь в обществе «Спартак», в 1963 году команда вновь сменила название на «Кубань».
В 1971 году команда перешла в ДСО «Урожай», которому были присущи жёлто-зелёные цвета. В 1973 году в третий раз кубанцы становятся чемпионами РСФСР.
В 1980 году «Кубань» дебютировала в Высшей лиге СССР, где выступала три сезона до 1982 года.
Четырежды «Кубань» становилась чемпионами РСФСР, заключительная победа в 1987 году.
В российском футболе, в 1992 году, «Кубань» дебютировала в Высшей лиге. На высшем уровне жёлто-зелёные выступали затем неоднократно. В 2004, 2007, 2009 и с 2011 по 2016 год «Кубань» была участником Премьер-Лиги.
Высшим достижением стало 5-е место в сезоне 2012/2013, обеспечившее участие в Лиге Европы УЕФА в сезоне 2013/14.
А уже в мае 2015 года жёлто-зелёные стали финалистами Кубка России.
За 97 лет существования команды были взлеты и падения, смены названия и эмблем, клубных цветов, но история старейшей краевой команды продолжается благодаря её болельщикам!